In een ziekenhuispopulatie (klinisch en poliklinisch) is, in tegenstelling tot de huisartspraktijk, de diversiteit van de verwekkers groot. In 2019 E. coli < 50% van de gevallen geïsoleerd.

Gezien de uiteenlopende gevoeligheidspatronen van deze bacteriën is het noodzakelijk om vóór start van de therapie een kweek af te nemen.

De nitriettest en bepaling van leukocyten in een sediment zijn niet geschikt voor screening van ziekenhuispopulaties. De nitriettest heeft  een gevoeligheid van slechts 50%. Afwezigheid van leukocyten in een sediment sluit een infectie niet uit. Met name ureumsplitsende bacteriën, waaronder Proteus soorten, veroorzaken lysis van leukocyten waardoor deze niet meer in de urine zijn waar te nemen. Anderzijds vindt men soms leukocyturie waarbij de banale kweek van de urine negatief uitvalt. Dit is m.n. het geval bij urethritis, niertuberculose, blaaspoliepen en -tumoren, kort na operaties aan de urinewegen of kort na therapie.